从公元前331年春，希腊马其顿王亚历山大占领波斯首都苏萨，正式结束波斯帝国对巴勒斯坦地区的控制；到公元前63年，罗马将军庞培将巴勒斯坦、叙利亚设为罗马行省，这一段时期的历史为犹太史的希腊时期。
亚历山大帝在推行军事扩张的同时，大力推行希腊文化。埃及、亚洲各民族在这一时期里都深受希腊文明的强烈影响和冲击。公元前332年下半年，亚历山大占领埃及之后，以他的名字命名的亚历山大城成为希腊式生活方式和希腊文化的著名中心。亚历山大梦想建立一个用希腊文化装备起来的世界。因为他坚信希腊文明代表了当时人类的最高文明。亚历山大帝实际上把他的世界范围的军事行动看作传播希腊文明的手段。史料证实，埃及境内的犹太人(尤其是亚历山大城的犹太人)把亚历山大看作将他们从波斯暴政下解救出来的救星。这批犹太人从“第一圣殿”被毁以后陆续流徙到埃及，他们以较为开明的态度接触埃及的文化，这种传统也使他们很快跟亚历山大提倡的希腊文化协调起来。
亚历山大死于公元前323年。随后他的庞大帝国解体成为三部分：安提柯王朝统治下的希腊、马其顿；托勒密王朝统治下的埃及；以及远东的两河流域叙利亚地区建立的塞琉古王朝。为争夺东方霸权，托勒密王朝与塞琉古王朝进行了长达80年的“叙利亚战争”。从托勒密二世的时代(公元前276年)持续到托勒密五世时代(即公元前195年)止，战争共进行了五次。巴勒斯坦地区成为王国战争的焦点。埃及人首先控制了该地区，公元前201—前195年间，塞琉古王朝的安条克三世从埃及托勒密五世手中夺取巴勒斯坦和腓尼基，犹太人转而由叙利亚人统治。尽管两个王朝在政治上互相敌视，但他们同样醉心于希腊文化。亚历山大帝向世界传播希腊文化的政策依然得到实施。托勒密王朝统治期间，越来越多的人移居埃及，亚历山大城成为犹太人的聚居的中心。据有关史料的统计，公元1世纪时，全埃及有犹太人100万人。希腊语成为当时的通用语言。埃及犹太人非常热心地学习希腊语，建立健身场、戏院和体育馆，模仿希腊式的生活方式。阿拉米语(即亚兰文)在埃及和在巴勒斯坦一样，对犹太人生活的影响逐渐减小。这段时期，托勒密二世(公元前285—前246年)根据亚历山大图书馆馆长底米丢的建议，邀请熟悉希腊文和希伯来文两种文字的专家翻译希伯来文《圣经》，即后来著名的希腊文《七十子译本》。因为语言不可避免地制约人们的思考方式，所以在泛希腊文思潮的影响下，这段时期说希腊语的犹太人也创作了一些作品。在希伯来思想的背景下，亦深刻地打上了希腊精神的烙印。但是，托勒密王朝推行的希腊文化政策并不是强制性的，相反，并不要犹太人放弃自己的文化。托勒密三世(公元前246—前221)非常尊重犹太人的信仰传统。在一次参观耶路撒冷时，他在圣殿里向耶和华神献了祭。在托勒密王朝温和的保护政策下，许多犹太人热烈欢迎希腊化，尤其是上层阶级和受过教育与从事商业的犹太人，他们对希腊文化有浓厚的兴趣。
塞琉古王朝前期对犹太人的态度与埃及人没有什么不同。安条克三世死后，儿子塞琉古四世继位，阿尼亚任耶路撒冷大祭司。据说这期间，圣城耶路撒冷平安繁荣。圣城金库存有120万银币与60万金币。塞琉古四世曾遣人去搜刮这笔财富，遭到犹太人的抵制(见《次经·玛喀比传下卷》第3章)。继塞琉古四世的安条克四世(公元前175—前163年在位)狂热地推行希腊化。他自称是“伊皮法尼斯”，即宙斯神的化身。在印有他的头像的钱币上铸有“神”的字样。尽管这种做法与亚历山大帝以来的传统并没有什么不同，但安条克四世在具体的希腊化过程中，则是采取了极端专制强暴的措施。在位前期，安条克四世并不绝对要求犹太人放弃自己的信仰，但是对宙斯的崇拜成为衡量一个人政治上忠诚与否的标准，而且崇拜宙斯亦即意味着崇拜神之化身的国王本人。很显然，正是这一点引起了希腊文化与希伯来宗教观念和反偶像崇拜思想的尖锐冲突。但是，安条克四世的强硬政策显然不仅仅是为了推行希腊化政策，而且是为了应付与托勒密王朝长期的战争和控制这个危机四伏的塞琉古帝国，安条克四世必须掠夺富有的巴勒斯坦经济资源。犹太人与叙利亚的矛盾逐渐尖锐起来。阿尔尼的兄弟耶孙以行贿的方式向安条克四世买到巴勒斯坦大祭司的职位。作为酬谢的代价，耶孙在耶路撒冷以国王的名义建造了一个希腊式的健身馆。但另一个叫买纳拉斯的犹太人也以更高的代价同样买到大祭司的职位。二人之间展开了激烈的权力之争，安条克四世乘机带兵进入圣城，掠夺圣殿并屠杀犹太人。之后，安条克四世与托勒密王朝发生战争。耶孙乘机从外地赶回耶路撒冷，企图驱逐买纳拉斯。安条克四世一方面为犹太人的反抗所震怒，另一方面在埃及的失利更促使他把怒气发泄到犹太人头上。公元前168年，安条克四世悍然下令宣布犹太教为非法，下令焚烧《托拉》，凡给儿子施割礼的母亲处以死刑，守安息日和收藏《托拉》者均处死刑。他又下令在圣殿里竖起宙斯的祭坛，并用犹太人视为不洁的猪进行献祭。外邦异神的祭坛在巴勒斯坦到处树立，犹太人被强迫向宙斯献祭并吃不洁的猪肉。叙利亚的军队深入到巴勒斯坦监督犹太人实行希腊化的政策。事实上，巴勒斯坦地区对希腊化采取全盘赞成态度的犹太人主要是犹太社会的上层贵族，如靠贿赂当上大祭司的耶孙和买纳拉斯等。犹太社会中要求抵制希腊化政策而保持犹太人身份的倾向一直存在。希腊人控制初期，犹太社团中业已出现哈西德党派(意即“忠诚、圣洁的人”)，这个教派大部分来自犹太下层社会中的农村，他们反对希腊化，强烈要求遵守《托拉》和坚守犹太人的传统。安条克四世的野蛮行径唤醒了犹太社团中的这一潜在潮流。公元前168年，耶路撒冷城西北的莫顶城的老年祭司马提亚向全城居民号召：“所有忠于上帝的圣约、服从上帝律法的人们，跟我来吧!”正式揭开玛喀比大起义的序幕。公元前166年，马提亚战死，其子犹大·玛喀比继任领袖。犹大英勇善战，勇猛无畏，其绰号“玛喀比”(意为“锤子”)，所以这次起义史称玛喀比起义。犹大·玛喀比击溃了安条克派遣的吕西亚大军的两次进攻。公元前165年，犹大进入圣城，在这一年的基流月(即11月)二十五日，他重建了圣殿的祭坛，恢复利未人的圣殿职务，这样就开始了以后犹太人的“献殿节”。随后，为争取独立，犹大领导犹太人不断与叙利亚军队进行战斗。公元前161年，犹大战死，他的两个弟弟约拿单和西门先后继任起义的领袖，继续反抗叙利亚的残暴统治。西门充分利用了塞琉古王朝内部的矛盾，终于在公元前143年，获得摆脱塞琉古王朝的胜利。从公元前143年到公元前63年罗马占领巴勒斯坦止，犹太人一方面继续与叙利亚对抗，另一方面又充分利用罗马兴起与叙利亚形成势力均衡的时代机遇，保持了80年的玛喀比王朝的独立。
玛喀比起义时期，由于对外族与希腊化态度的不同，以及内在政治经济地位的差异，犹太社团发生了急剧的分化。祭司贵族撒都该派代表犹太社会的权力阶层，他们是既得利益的享受者，因而对希腊化基本上持欢迎的态度。法利赛派由哈西德派发展而来，遵守犹太传统并主张清净苦修，这批人主要是文士、拉比，属于犹太教中精通律法书的知识分子，称法利赛派。另有艾赛尼派，主要来自犹太下层群众，他们信仰虔诚，是犹太传统的最热烈的维护者。法利赛派和艾赛尼派是玛喀比起义的参加者。独立以后，法利赛派与撒都该派之间的矛盾加剧。约翰·胡肯奴接替父亲西门掌握权力(公元前135—前105年在位)。他死后，其子亚里士多布鲁一世(公元前105—前104年在位)以及随后继承他的同父异母兄弟亚里山大·詹尼亚斯(公元前104年—前78年在位)都继续推行他的政策。詹尼亚斯死后，其妻亚历山大拉·撒罗米当了女王(公元前78—前69年在位)，积极支持法利赛派犹太教。女王死后，她的两个儿子胡肯奴二世和亚里士多布鲁二世为争夺王位展开激烈角逐，罗马将军庞培乘机派兵“调解”。公元前63年，庞培拘捕女王的两个儿子押送罗马，设立巴勒斯坦和叙利亚为罗马行省。犹太·玛喀比独立时期遂宣告结束。