美潜艇部队于1943年夏秋季在中太平洋的破交活动，使日本的运输舰船受到很大损失。7月1日，日军的“鸠”号扫雷艇和“壹岐”号护卫艇护送数艘运输船南行，进至帛琉港外时受到潜艇攻击。日第26号猎潜艇护送“筑紫”丸和“神国”丸从帛琉驶往腊包尔，7月7日在阿德米勒尔提群岛以北受到美潜艇的攻击，“神国”丸被击伤。同日，在贾卢伊特附近进行对潜搜索的“宇治”丸，没有发现目标，反而受到潜艇攻击。
7月10日，日运输船“爱国”丸(10437吨)在特鲁克以北17海里处遭到潜艇攻击，中雷进水，但尚可航行。11日，由第17号、第18号扫雷艇护卫的“墨西哥”丸、“华阳”丸、“保津川”丸和“大兴”丸(上述船艇编成O－404护航运输队)，在帛琉西北300海里处遭到美潜艇的袭击。其中“大兴”丸(1925吨)被击沉。同日，“第八鹰取”丸在硫黄岛以西被美潜艇击沉。
7月15日深夜，由渔船改装的侦察监视艇“第一福神”丸，在马绍尔群岛北部的汤吉岛附近(北纬14度、东经168度10分)执行任务时，受到美潜艇的炮击。18日，由日猎潜艇第29号和“第六京”丸护送的海军省运输船“第二十御影”丸(2718吨)，从夸贾林岛驶至威克岛以南约50海里水域时被潜射鱼雷击沉。
日本的0－505护航运输队于7月中旬经丰后水道南下，驶往帛琉，21日在帛琉以北约500海里处遭到美潜艇的攻击，队中的“塞班岛”丸(5532吨)中雷沉没。7月24日，日海军省运输船“第三图南”丸(19209吨)在“玉波”号驱逐舰的护卫下，驶至特鲁克以西230海里水域，被美潜艇“廷奴沙”号发射的鱼雷击中，丧失了航行能力。日军于当天从特鲁克基地派巡洋舰“五十铃”号、驱逐舰“朝凪”号以及其他军舰前去接应，次日抵达现场，拖带“第三图南”丸向东航进，于28日回到基地。
日独立混成第21旅团的坦克部队以及其他官员约300人，乘两艘运输船在“鹎”号护卫艇的护送下，于7月23日离开腊包尔，驶往特鲁克。25日，驶至特鲁克西南海域(北纬2度46分、东经148度35分)受美潜艇“波姆庞”号的鱼雷攻击。其中的“蒂姆兹”丸(5871吨)当即沉没，而“金泉”丸(3081吨)因前部断裂已不能航行。日军遂派“第二长安”丸于27日驶抵现场进行拖带，31日进入特鲁克港。
7月30日，“苏里”号美潜艇在冲绳岛与硫黄岛之间发现3艘日本舰船，随即下潜接敌，准备占据有利阵位，以艇首发射管进行攻击。当离目标约5000米时，艇长命令浮到潜望镜深度。但从潜望镜里还看不清舰船侧影，根据声纳员对螺旋桨转动声音的测定，艇长决定改变航向。转向时，潜艇的下潜深度超过了潜望镜深度。正在这时，潜望镜的升降机械发生故障。当潜艇转入新航向后，已离目标很近。升起潜望镜，看到一个舰舷在左舷正横愈来愈大。潜望镜还没有来得及收回，就听到咔嚓嚓的声音，潜艇急剧向右横倾5度，但未遭到深弹攻击。后来潜艇浮出水面，发现潜望镜已被撞弯，上层建筑物也被撞坏。
8月1日，日飞机运输舰“最上川”丸在特鲁克附近被美潜艇“波吉”号击沉(一说是7月11日被击沉的)。8月5日，日运输船“昌寿”丸(1991吨)在南鸟岛以东海域(北纬24度30分、东经158度30分)，被潜射鱼雷击沉。日运兵船“鸣门”丸(7148吨)在“朝凪”号驱逐舰护送下从塞班岛返回横须贺，8月8日驶至硫黄岛东南被美潜艇击沉。8月13日，日军父岛巡防区所属的改装炮舰“江户”丸(1299吨)，在小笠原群岛以南(北纬24度4分、东经142度21分)被美潜艇击沉。8月22日，日陆军征用船“西山”丸(3017吨)，在帛琉东南(北纬2度58分、东经136度21分)被美潜艇“锯鳐”号击沉。同一天，日海军省运输船“会昌”丸(4164吨)，在特鲁克西北(北纬10度13分、东经147度20分)被另一艘美潜艇击沉。8月27日，日陆军征用船“大福”丸(3520吨)，在丰后水道南口被潜艇击沉。同日，日海军运输船“东海”丸(8359吨)，在关岛锚地停泊时被潜艇击沉。
9月2日，日“六连”号海防舰护送运输船行至特鲁克以北的鲁库提岛附近，被“麝香鳖”号美潜艇击沉。9月3日，日海军省运输船“田子浦”丸(3521吨)，在御藏岛东南被潜射鱼雷击沉。9月4日，日第4舰队所属运输船“平壤”丸(2627吨)在波纳佩西南(北纬3度48分、东经160度38分)，被“大青花鱼”号美潜艇击沉。9月5日，日陆军征用船“天海”丸(3203吨)运送陆军部队行至威瓦克(新几内亚岛)以北25海里水域，被“锯鳐”号美潜艇击沉。9月8日，日陆军征用船“第十三博铁”丸(1334吨)在威瓦克以北120海里外，被美潜艇“鼓鱼”号击沉。9月11日，日海军省运输船“北照”丸(4211吨)，在瑙鲁岛以西8海里处被美潜艇“一角鲸”号击沉。同日，日海军运输船“阳光”丸(1050吨)在御藏岛以西2海里处，被另一艘美潜艇击沉。9月18日，日陆军征用船“关西”丸(8614吨)在阿德米勒尔提群岛以北(北纬1度5分、东经146度27分)，被“斯坎普”号美潜艇击沉。9月20日，日水上飞机母舰“能登吕”号，在特鲁克以西100海里处被美潜艇发射的鱼雷击中，起火破损。9月23日，日海军运输船“两德”丸(1384吨)在马里亚纳群岛西北(北纬20度45分、东经12度)，被潜射鱼雷击沉。当时，与它一起航行的“山城”丸(3427吨)也被击成重伤后沉没。9月24日，日轻型航空母舰“大鹰”号在父岛东北约200海里处被潜艇击伤，失去航行能力。9月28日，“泰安”丸(3670吨)在塞班岛以北约60海里处，被潜射鱼雷击沉。9月30日，日陆军征用船“前桥”丸(7005吨)从帛琉驶往腊包尔，途经帛琉东南约300海里处时，被“布基”号美潜艇击沉。
10月1日，日第8舰队运油船“东宁”丸(4930吨)、陆军征用船“金华山”丸(4980吨)以及其他3艘运输船，在2艘巡逻艇和1艘猎潜艇的警戒下，航行到沃累艾岛以南海域时受到潜艇攻击。“东宁”丸和“金华山”丸被“彼托”号美潜艇击沉。10月6日，从吴港驶往特鲁克的日海军运油舰“风早”号(2万吨)，行至特鲁克西北250海里处受到“奴廷沙”号、“盖瓦鳄”号两艘美潜艇的攻击，并被击沉。10月8日，日陆军征用船“加洲”丸(5460吨)在阿德米勒尔提群岛以北(南纬0度26分、东经146度17分)，被“鹤鱼”号美潜艇击沉。10月11日，日海军运输舰“间宫”号从横须贺出发南行，12日行至南方群岛西北(北纬28度3分、东经137度28分)时，被美潜艇击伤。日联合舰队司令长官命令“五十铃”号(该舰正在从特鲁克驶往上海的途中)前去援救。这艘日舰于15日与“朝风”丸所拖带的“间宫”号在海上会合。“间宫”号于17日被拖入佐伯港。
德国的袭击舰(由商船改装的巡洋舰)“米西黑尔”号(4740吨，舰员378人)，在南太平洋实施破交作战后向日本驶去。10月17日，在伊豆以南海域被美潜艇击沉，其舰员除98人乘舰载汽艇漂泊到静冈县海岸得救外，其余全部丧生。
10月18日，日陆军征用船“大偏”丸(1915吨)在阿德米勒尔提群岛西北约300海里处，被美“银鱼”号潜艇击沉。10月20日，日第11航空战队所属的“五洲”丸，在乌利西群岛东南约150海里处被美潜艇击成重伤。10月23日，日本0－006护航运输队中的“天南”丸(5407吨)、“净宝缕”丸(6187吨)、和“华山”丸(1893吨)，在阿德米勒尔提群岛西北(北纬2度0分、东经144度46分)被美潜艇“银鱼”号先后击沉。10月27日，日本弗－60护航运输队的“南满”丸(6550吨)，在帛琉以北被美潜艇击沉。美潜艇这一时期的活动，使日本在中太平洋的海上运输线遭受了严重破坏。