日军向菲津宾发动进攻时，美亚洲舰队首先以其潜艇部队进行迎击。它把所属的大部潜艇部署在吕宋岛周围以及台湾、帛琉与菲律宾之间海域。赋予这些潜艇的任务是，一边侦察日军的防潜警戒和反潜手段，一边监视和截击敌人。活动于菲律宾群岛以西的“旗鱼”号美潜艇，12月16日(1941年)在中国南海发现数艘日本舰船，并将其中1艘击沉。后来查明，被击沉的是日运输船“热田山”丸(8663吨)。在仁牙因湾附近执行任务的“海鳐鱼”号美潜艇，于12月21日发现了日登陆输送队，并立即向指挥部报告。戴尔海军少将派“S－38”号、“S－40”号等4艘潜艇前去截击日军。但日登陆输送队这时已经进入湾内，除“S－38”号潜艇对日运输船“巴洋”丸发射鱼雷，并将其击沉外，其他潜艇皆未能进行攻击。
美潜艇在12月份中，对驶往菲律宾的日军登陆输送队先后实施31次袭击，发射66条鱼雷，可是仅击沉两艘日船，未能达到迟滞日军进攻的目的。后来发现出现这种情况的一个重要原因是鱼雷本身存在着严重缺陷，鱼雷射出后常常不是偏离目标，就是提前爆炸。