1946年12月9日至24日在瑞士的巴塞尔举行。这时的政治形势是：第二次世界大战已经结束；纳粹德国对犹太人的血腥屠杀终于大白于天下；欧洲的犹太社团已几乎不复存在；巴勒斯坦的伊休夫已经开始了武装反对英国托管当局的斗争；修正党回到了犹太复国主义者协会，并派出代表团参加大会；旨在巴勒斯坦建立犹太人共同体的巴尔得摩计划(1942)，已经在1945年纽约召开的第一届国际犹太复国主义者会议上，被批准为现阶段犹太复国主义运动纲领；英美委员会发表了一份报告，主张废除白皮书，立即给10万犹太人发放迁入巴勒斯坦许可证，取消对犹太人购买土地的各种限制；然而，英国政府拒绝接受英美委员会的建议；伊休夫武装抵抗运动开始加强；伊休夫和犹太代办处的领导人被托管当局逮捕；莫里森计划(在巴勒斯坦建立由4个区域组成的联邦方案)已经公布；英国建议在伦敦召开犹太人一阿拉伯人会议，以寻找一项共同解决方案，并宣布在会议开始前释放犹太领导人。代表大会正是在这一形势下举行的。大会面临的最紧迫问题是对莫里森计划和伦敦会议确定犹太人的立场。魏兹曼强调了在巴勒斯坦建立一个犹太人国家的重要性，以及争取获得美国总统杜鲁门和美国公众对犹太复国主义运动和伊休夫事业的同情和支持的重要性。大会经过辩论通过了“建立一个与世界民主体制相适应的犹太人国家”的政治纲领，否决了莫里森计划中提出的在巴勒斯坦建立一个阿拉伯一犹太人联邦的方案，同时拒绝参加拟议中的伦敦会议。魏兹曼由于反对最后一项决议，赞成出席伦敦会议，宣布辞去主席职务。大会没能选出一位新的主席，主席职位宣告暂缺。这在犹太复国主义者协会历史上尚属首次。这也是魏兹曼最后一次出席代表大会。
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