鉴于所罗门、新几内亚地区的战局日趋恶化，日军大本营于1942年11月16日通知侵华的派遣军总司令，将其所属的第6师团(师团长为神田正种陆军中将)调入在东南线作战的第8方面军。12月13日，大本营海军部决定于12月下旬把第6师团从上海运往南太平洋，并以“六号输送”作为这次行动的秘语代号。
12月18日，军令部总长下达指令，对这次行动按下述部署分区护航：从上海到马公，由支那方面舰队(即日军的侵华舰队)负责，从马公到东经136度附近，由西南方面舰队负责；此后航程的警戒，由联合舰队司令长官组织实施。
第6师团的海上航渡分为三个阶段。第一阶段编成3支运输队。第1运输队(5艘运输船)和第2运输队(7艘运输船)，在“栗”号和“莲”号驱逐舰的护送下，12月21日从上海的吴淞港出发，24日到马公。然后改由“帆风”号、“长月”号驱逐舰护送，25日16时从马公起航，1943年1月1日抵达帛琉。载运第6师团余部的第3运输队(4艘运输船)在“栂”号、“丸月”号驱逐舰的护送下，25日从吴淞出发，28日到马公，29日离开马公港，1943年1月5日抵达帛琉。
第二阶段为从帛琉到特鲁克的航渡。上述运输队到达帛琉后重新编组，以“帝洋”丸、“贺茂”丸、“大平”丸、“神爱”丸“大井川”丸、“乾坤”丸、“旭盛”丸、“第一真盛”丸、“妙法”丸、“巴拿马”丸(在帛琉增加的)、“染殿”丸为新编1队，1月4日从帛琉出发，11日进入特鲁克港，以“明宇”丸、“苏腊巴亚”丸、“帝龙”丸、“神龙”丸、“望加锡”丸和“和浦”丸等为新编2队，10日从帛琉出发，15日进入特鲁克港。
第三阶段为从特鲁克到布干维尔岛的航渡。由于在这段航路上经常出现美军的飞机和潜艇，日军又将上述运输船只再次重编，组成A、B、C、D护航运输队。
A护航运输队的输送船只为“帝洋”丸、“妙法”丸和“第一真盛”丸，在“时雨”号驱逐舰的护送下于1月15日从特鲁克出发，20日进入埃利本达港(布干维尔岛南部)。A队于19日行至肖特兰以北水域时曾受到潜艇攻击，“妙法”丸(4122吨)被击沉。当时，刚进入肖特兰港的日驱逐舰“秋月”号，奉命立即出港搜索和攻击美潜艇。“秋月”号不仅未能发现目标，反而于19日夜和20日两次受到潜艇攻击，其锅炉舱中雷进水，亡14人，伤63人。攻击上述日舰船的，是美潜艇“剑鱼”号。
B护航运输队的输送船只为“大井川”丸、“巴拿马”丸、“旭盛”丸、“乾坤”丸，在“白雪”号驱逐舰的护送下于1月17日从特鲁克出发，22日进入埃利本达港。在航渡过程中，B队曾于21日在奥耶马岛(布干维尔岛东南)附近受到袭击，“乾坤”丸(4575吨)被击沉。据日方史料记载，“乾坤”丸是被美军飞机炸成重伤后沉没的，而在《第二次世界大战中美国潜艇的战斗活动》一书中则说该船是被美潜艇“加托”号击沉的。
C护航运输队编有“明宇”丸、“染殿”丸、“苏腊巴亚”丸和“神爱”丸4艘运输船，由第11号猎潜艇和“第二长安”丸担任护航，1月19日从特鲁克出发，24日进入埃利本达港。20日行至卡维恩以北海域(北纬3度24分、东经151度13分)时曾受到潜艇袭击，其中“苏腊巴亚”丸被击沉，“明宇”丸被重创。第11号猎潜艇急速进行深弹攻击，并向上级报告说已将该潜艇击沉。21日，特鲁克基地派“朝云”号驱逐舰前去救助，但“明宇”丸因伤势过重已经沉没。“朝云”号也曾发现敌潜艇，并进行了深弹攻击，但效果不明。战后查明袭击C护航运输队的是美潜艇“银鱼”号，它安然无恙地返回了基地。
D护航运输队编有运输船7艘(船名不详)，由第12号猎潜艇和“第二长江”丸担任护航，1月20日从特鲁克出发，23日进入埃利本达港。“苏腊巴亚”丸沉没时，“第二长江”丸于21日赶到现场救起陆军官兵699人和船员49人。“时雨”号驱逐舰在完成对A队的护航任务后向特鲁克返航时，又于途中参加了对D队的护航。
这样一来，日军自1942年12月21日开始实施的“六号输送”行动，至1943年1月24日结束。在渡海过程中，有4艘运输船被击沉，船上载运的官兵大部丧生。