中胚层指在三胚层动物胚胎的胚层奠基时(原肠胚末期)，处在外胚层和内胚层中间的细胞层。中胚层发育为躯体的真皮、肌肉、骨骼及其他结缔组织；血液淋巴组织和循环系统，包括心脏、血管、骨髓、淋巴结、淋巴管等；体腔膜，内脏的浆膜和系膜，以及内脏中的结缔组织、血管和平滑肌层等；肾脏、输尿管、生殖腺(不包括生殖细胞－一般认为来源于内胚层)、生殖管和肾上腺皮质部。鸟类、哺乳类另有胚外中胚层，组成胚膜的衬里(结缔组织、血管等)。
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